Intraarterielle Chemotherapie, Komplikationen wie Blutungen in der Leistengegend oder Obstruktion der Arterien aufgrund eines angiographischen Verfahrens können selten gesehen werden. Darüber hinaus sind die meisten Nebenwirkungen Komplikationen im Zusammenhang mit Chemotherapeutika, wie Schmerzen, Übelkeit, erhöhter Blutdruck und verminderte Blutwerte. Bei der intraarteriellen Chemotherapie sind die systemischen Nebenwirkungen geringer, aber die lokalen Nebenwirkungen können größer sein, da das Medikament stark in einem Bereich verabreicht wird. Die häufigsten lokalen Nebenwirkungen sind Schmerzen und vorübergehende Rötung in dem Bereich, in dem das Medikament verabreicht wird.